Οι ασθενείς θα πρέπει να έχουν λάβει κάποιου είδους προετοιμασία του εντέρου. Η ευκολότερη στην εκτέλεση είναι αυτή που χρησιμοποιείται από τους ακτινολόγους για την προετοιμασία των εντέρων για ακτινογραφία. Η λιγότερη δαπανηρή είναι ένας συνδυασμός ενός στοματικού καθαρτικού το πρωί και το βράδυ την ημέρα πριν από τη υστεροσκόπηση και υποκλυσμό περίπου δύο ώρες πριν από τη διαδικασία.
